Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms