Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ryr1E9PZQ0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms