Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gimd1E9PW74 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gimd1E9PW74 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms