Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms