Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms