Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Soga1E1U8D0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Soga1E1U8D0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms