Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim12cD3Z3L3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms