Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms