Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd1D3YXK1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd1D3YXK1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms