Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2d4D3YUH6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms