Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms