Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cttnbp2B9EJA2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms