Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pdzd8B9EJ80 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pdzd8B9EJ80 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd8B9EJ80 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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