Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnldc1B2RXZ1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms