Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms