Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apba1B2RUJ5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms