Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms