Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spocd1B1ASB6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms