Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PtprsB0V2N1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PtprsB0V2N1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PtprsB0V2N1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PtprsB0V2N1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PtprsB0V2N1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PtprsB0V2N1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PtprsB0V2N1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprsB0V2N1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms