Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4A4UUI3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms