Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl41A2AUC9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms