Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn3aA2ASI5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn3aA2ASI5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms