Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rtf1A2AQ19 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rtf1A2AQ19 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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