Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb1A2AQ07 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms