Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1aA2APX8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms