Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ambra1A2AH22 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ambra1A2AH22 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms