Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc163A2AGD7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc163A2AGD7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms