Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmpd4A2AFR3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Frmpd4A2AFR3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms