Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Pramef6A2A8M8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pramef6A2A8M8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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