Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prdm2A2A7B5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prdm2A2A7B5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms