Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkd2l1A2A259 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms