Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms