Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms