Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ubl3Q9Z2M6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ubl3Q9Z2M6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubl3Q9Z2M6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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