Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tulp1Q9Z273 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp1Q9Z273 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms