Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpne6Q9Z140 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms