Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NgfrQ9Z0W1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms