Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13bQ9WU72 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms