Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc2Q9R244 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms