Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp6ap1Q9R1Q9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1Q9R1Q9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms