Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Six6Q9QZ28 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Six6Q9QZ28 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Six6Q9QZ28 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Six6Q9QZ28 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Six6Q9QZ28 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Six6Q9QZ28 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Six6Q9QZ28 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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