Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms