Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms