Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tgm1Q9JLF6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tgm1Q9JLF6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tgm1Q9JLF6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tgm1Q9JLF6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgm1Q9JLF6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms