Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Habp4Q9JKS5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms