Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms