Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ube2j1Q9JJZ4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ube2j1Q9JJZ4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2j1Q9JJZ4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms