Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms