Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cog8Q9JJA2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cog8Q9JJA2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cog8Q9JJA2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cog8Q9JJA2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cog8Q9JJA2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cog8Q9JJA2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cog8Q9JJA2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cog8Q9JJA2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cog8Q9JJA2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cog8Q9JJA2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cog8Q9JJA2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms