Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EefsecQ9JHW4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EefsecQ9JHW4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms